船长(英文:Captain、Master或者Ship Master),是船上拥有航行执照中最高阶的航海指挥官。船长的职责在于维护全船的安全及有效的运作,包括乘载货物的管理维护、航行、船员管理以及确保船舶符合港口国及国际公约之规定,和船籍国与船东(航商)的政策。
与民用船只不同,武装船只(如军舰及海巡船舰)的船长通常会根据所属舰艇的吨位称为舰长或艇长。
船长负有在船舶发生事故或是旅客、船员发生事故(生病、受伤或死亡)时,提出书面报告及提供有关案件的说明与证明的责任及对其负责。
不同于地面车辆上的驾驶员及飞机上的机师,中大型船舶的船长通常只会作出指挥,而不会直接操控船只(部分商船船长会在靠离码头时,在驾驶台亲自操纵船舶,以维持所需要的操作精准度),实际操控工作由舵工及船副负责。
另外,在一些以太空为题材的作品中,太空飞行器的最高指挥官有时候也会被称呼为“船长”或者“舰长”。
旧式风格的船长一般都拥有大胡子,如果是海盗船船长,经典造型是独眼,一只手是铁钩,一条腿是木棍。