真菌感染可引起的疾病，称为真菌病。根据侵犯人体部位的不同，可以将真菌感染性疾病分为浅表真菌感染，皮肤真菌感染，皮下组织真菌感染和系统性真菌感染。其中，浅表真菌感染和皮肤真菌感染统称为浅部真菌感染，皮下组织真菌感染和系统性真菌感染统称为侵袭性真菌感染。随着大剂量免疫抑制剂、化疗药物以及广谱抗生素的滥用，使得免疫抑制的患者逐渐增多，真菌感染的患病率和致死率在全球呈上升趋势。临床上常用的真菌感染的诊断方法主要有直接涂片法，真菌培养法，以及病理学组织检查等方法。真菌涂片检查是是真菌检测的首选步骤其优点在于简便快速。无菌部位的阳性结果可直接确定真菌感染。

检查有无真菌感染。真菌涂片检查对于浅表和皮肤真菌感染最有帮助。若在毛发、皮肤刮屑或甲标本中发现念珠菌、皮肤癣菌和马拉色菌的成分，可提供对相应真菌病的可靠诊断。若在无菌体液的真菌涂片检查中发现真菌成分常可确立深部真菌病的诊断。但一般在有菌部位则只有发现大量真菌菌丝才有意义。通过直接镜检一般可以区分念珠菌、毛霉（接合菌）、暗色真菌、隐球菌等真菌的感染，进一步明确鉴定菌种需要通过培养鉴定来完成。

涂片未找到真菌，正常痰内可能有少量芽生孢子。