在病因链或病因网中，所有与疾病发生直接相关的病因称为直接病因(direct cause)，对应于疾病因素模式中的近因。如在病因链“静脉注射吸毒→共同使用注射器→注射器污染HIV→病毒感染→艾滋病发作”之中，HIV感染称为直接病因，而它以前的因素都称为间接病因。另外，这里直接与间接的区别只是相对的；如在上述病因链中，HIV感染与艾滋病发作之间还可以插入CD4+ T细胞被破坏这个中间因素，HIV感染则成了间接病因。

医学研究各领域所涉及的病因可能只是病因链中的某一个环节，只有综合起来，才能够正确地诊断疾病。

疾病因素模式在病因分类上相对清晰，具有较强的可操作性，在实际工作中有一定的指导意义。其主要特点是将疾病的危险因素分为内外两个层次：外围的远因和致病机制的近因。外围的远因包括社会经济、生物学、环境、心理行为和卫生保健等五大类主要因素。内层的近因主要是指与发病直接相关的医学生物学因素，如致病基因、生理性缺陷或病理性改变。流行病学的危险因素主要指外围的远因。

病因作用的联接方式是研究病因作用途径和机制的重要内容，也是构建上述各种病因模式的重要基础，并具有预防措施上的指导意义。包括：

1.单因单果模式
单因单果模式与决定论的病因观相对应，在逻辑上病因是疾病发生的充分必要条件。这类病因模式实际中比较少见，常见于一些严重的显性遗传病或急性物理或化学性损伤等，如先天愚型、放射病、烧伤和烫伤等疾病。

2.多因单果模式
多因单果模式是指多个病因引起单一疾病，例如高血压、高脂血症、肥胖、糖耐量异常、高胰岛素血症与吸烟引起急性心肌梗死。从疾病的多因性来看，这无疑是正确的。但是这并不意味着这些病因仅仅导致单一的疾病。

3.单因多果模式
单因多果模式是指单一病因引起多种疾病，例如吸烟可引起肺癌、慢性支气管炎和冠心病。从病因的多效应来看，这无疑是正确的。同理，这也并不意味着这一疾病仅仅具有这种单一的病因，即可能有其他病因。④多因多果模式：多因多果模式是指多个病因引起多种疾病，例如高脂膳食、缺乏体力活动、吸烟和饮酒引起脑血栓、心肌梗死、大肠癌和乳腺癌。这些疾病的多个病因可能是完全共同，也可能是部分共同。多因多果实际上是将单因多果与多因单果结合在一起，全面地反映了事物的本来面目。